Landgoed Eyckenstein is onderdeel van de Utrechtse Heuvelrug. Het ligt in de Laagte van Pijnenburg, een lager gebied dat de Heuvelrug met het Gooi verbindt. Zoals de hele Utrechtse Heuvelrug kenmerkt dit gebied zich door een hoge dichtheid aan landgoederen en buitenplaatsen.

Eyckenstein is een complex rijksbeschermde buitenplaats. Dat betekent dat het geheel, het ensemble, bijzonder is en als zodanig instandgehouden moet worden. Naast het ensemble hebben negen onderdelen van landgoed Eyckenstein de status Rijksmonument met een eigen monumentnummer. Eén daarvan is het landhuis, maar ook het park achter het huis, het moestuinensemble en de Orchideeënkas in de moestuin. Het Boschboerderijtje langs de Eikensteeg en de Mauritshoeve zijn gemeentelijke monumenten.